Започва да учи музика първо при баща си Нарцисо Йепес и завършва флейта в Кралската консерватория в Мадрид. Учи също така дирижиране и анализ при Надя Буланже и Игор Маркевич, флейта при Франсиско Казановас (барокова флейта) и Рикардо Канджи (блокфлейта). Има диплом за дирижиране от Академия Киджана в Сиена при Генадий Рождественски и от Школата за диригенти Pierre Monteux в САЩ при Чарлз Брук. Като флейтист (солист или в камерни формации) е концертирал в Европа, Америка, Япония и Корея. Защитава докторат по образователни науки, завършил е и математика и астрономия.